(1)、瑞金医院是上海交通大学医学院较大的临床教学基地，瑞金临床医学院现设临床医学和医学检验学两个专业，38个教研室，承担临床医学五年制、8年一贯制、医学检验专业的教学任务，并接受来自20多个和地区的留学生教学任务，是上海市教委授牌的留学生实践教学基地。瑞金医院也是上海较大的住院医师规范化培训基地，每年培训住院医师约250人。同时，瑞金医院外科培训基地是英国爱丁堡皇家外科学院、香港外科医学院联合认证的外科住院医师培训基地。(2)、神经外科：上海第二医科大学附属瑞金医院神经外科由沈建康教授任科主任、赵卫国教授任科副主任，并在瑞金医院闵行分院和台州分院开设神经外科。现有床位100张，正教授4名，副教授10名，主治医师15名，博士4名，硕士10名。该科先后获科技进步奖、卫生部科技进步奖、教委科技进步奖、上海市科技进步奖、上海临床科技成果奖等15项。(3)、泌尿科：瑞金医院泌尿科主治泌尿生殖系常见疾病，多发病及各种疑难杂症。尤其擅长肾上腺外科，每年不少于200例的肾上腺外科手术经验，包括嗜铬细胞瘤，柯兴综合征，原发性醛固酮增多症，肾上腺皮质癌等，居全国首位。肾脏移植也是本科的强项。每年有超过100例的移植经验。对于泌尿系结石，也有很丰富的诊治经验，包括体外冲击波碎石术，腔内碎石术及传统开放手术均有丰富的经验及先进的设备。并对泌尿系肿瘤，前列腺疾病，排尿功能障碍，生殖功能障碍，男性学的诊断和调节都有独特的方法。